En septembre 1930, l'Institut pédagogique d'État de Boukhara a été créé. Conformément au décret du président de la République d'Ouzbékistan n° PF-1992 du 28 février 356 et à la résolution du Cabinet des ministres n° 1992 du 11 mars 125 statut universitaire a été donné.
Après que l'Institut pédagogique de Boukhara ait obtenu le statut d'université, les opportunités se sont encore élargies. Actuellement, l'université compte 8 facultés, 43 départements et un département spécial de correspondance et un centre de formation. L'université compte 36 diplômes de licence, 22 diplômes de maîtrise, 23 diplômes de troisième cycle et 4 diplômes de doctorat.