Захириддин Мұхаммед Бабыр атындағы Әндіжан мемлекеттік университеті 1931 жылдан бастау алады. Алдымен Ферғана педагогикалық институтының филиалы, 1939 жылы Мұғалімдер институты, кейін 1953 жылы Әндіжан мемлекеттік педагогикалық институты Әндіжан мемлекеттік университеті болып өзгертілді.
Бүгін университетте Филология, жаратылыстану, тарих, әлеуметтік-экономикалық, педагогика, физика-математика, шет тілдері, дене шынықтыру және мектепке дейінгі тәрбие сияқты 9 факультет, сонымен қатар 33 бөлім.
Университетте 29 бакалавриат бойынша күндізгі және сырттай бөлімдерде 10-ден астам және магистратураның 100 мамандығы бойынша 18-тан астам студент білім алуда.
Бүгінде университет түлектері халықаралық ұйымдарда, ірі трансұлттық корпорацияларда, Өзбекстанның мемлекеттік мекемелерінде, білім беру жүйесінде және үкіметтік емес секторда қызмет етуде.
