Негiзiнде Өзбекстан Республикасы Министрлер Кабинетiнiң 1992 жылғы 28 ақпандағы қаулысымен 1975 жылдан бастап жұмыс iстейтiн Ташкент ирригация және ауыл шаруашылығын механикаландыру инженерлер институтының Қарши филиалы негiзiнде Қаршы аграрлық-экономикалық институты. аграрлық экономика институтының және Ташкент мемлекеттік техникалық университетінің Қарши филиалының, Қарши инженерлік экономика институты құрылды.
Қазіргі уақытта институтта 6 факультет: экономика, өндірістік технологиялар, кәсіптік білім, мұнай-газ, энергетика, машина жасау, 25 кафедра, ақпараттық технологиялар орталығы, дарынды студенттер орталығы, институт жанынан 2 академиялық лицей бар. 30 мамандық бойынша 5912 бакалавр, 4 мамандық бойынша 100-ден астам магистрант бар.